المشاركة الأصلية كتبت بواسطة العراقي الطائي

تم بناء المسجد من 876 إلى 879 في عهد أحمد بن طولون ، الذي حكم مصر بين عامي 868 و 884 كحاكم للخلفاء العباسيين وقاد البلاد إلى الاستقلال الفعلي . أرّخ المؤرخ المصري المقريزي تاريخ بداية البناء (1364-1442) ، [1] وقد تم تسجيل اكتمال البناء على لوحة كتابية بالمسجد.

تم بناء المسجد على جبل ياشكور الصغير ("تل عيد الشكر"). تزعم أسطورة محلية أن سفينة نوح قد هبطت هنا بعد الطوفان [2] وأن الأسطح المحفوظة قد بنيت من الخشب.

شكل المسجد مركز القطيع ، العاصمة الناشئة لابن طولون ، بالقرب من الفسطاط التي حكمت منها إمبراطورية السلالة الطولونية التي أسسها . كان المسجد يقع في الأصل بجوار قصر ابن طولون ، ومنه كان باب بجوار المنبر يتيح له الوصول المباشر إليه. هُدم القطعي في أوائل القرن العاشر ، ولم يتبق سوى المسجد.

تم بناء المسجد على طراز سامراء مع هيكل عباسي . وتتكون من رواق مغطى يحيط بالفناء الداخلي ، وتواجه أكبر قاعة باتجاه مكة باتجاه القبلة . كان للمسجد الأصلي بئر الوضوء ( السبيل ) في المنطقة الواقعة بين السور الداخلي والخارجي. في القرن الثالث عشر ، كان لدى السلطان لادشين سبيل آخر بسقف مقبب مرتفع مضاف في وسط الفناء الداخلي.